Klockan 04.12 på söndagsmorgonen larmades polisen om inbrottet där någon krossat en ruta och tagit sig in och stulit kontanter i kassan.
– Vi lämnade lokalerna vid tre och sedan hörde grannen något strax efter fyra och larmade polisen, berättar Nunnan och Bageriets ägare Vasilis Kanellos.
Han är förundrad över fräckheten i inbrottet. Det är mycket folk på Stora torget, även sent på natten.
– Det måste ha varit en desperat och kanske påverkad person, tror Vasilis Kanellos.
På lördagskvällen hölls en stor insamlingsfestpå både Bageriet och Nunnan med mat och åtta band som spelade. Pengarna från kvällen går till det jordbävningsdrabbade Nepal.
– Kontanterna vi fick in under kvällen har vi tack och lov på ett annat ställe så de finns kvar. Men vi vet ännu inte hur mycket som har blivit stulit. Vi tror det är drygt 20 000 men vi har ännu inte fått komma in och kontrollera, säger Vasilis Kanellos.
Polisen har spärrat av brottsplatsen och en teknisk undersökning kommer att göras, troligen på måndag.
VasilisKanellos ska försöka hålla Nunnan öppen under söndagen. Det är osäkert om Bageriet kan öppna till måndagen.
Vid 18-tiden på söndagskvällen hade inte någon misstänkt gärningsman gripits för inbrottet.
Tror du att inbrottstjuven var ute efter pengarna som hade samlats in till Nepal under kvällen?
– Det är det ingen som vet. Det blir bara gissningar, säger Vasilis Kanellos.