Sjöfartsverket vill att Naturvårdsverket tar över fastigheterna i befintligt skick och utan kostnad. Däremot vill man att Sjöfartsverkets personal ska kunna övernatta i sjöboden även i framtiden, utan kostnad.
Ön Gotska Sandön ägs av staten, Naturvårdsverket. Länsstyrelsen driver nationalparken Gotska Sandön.