Skolan anklagas för att inte ha gjort tillräckligt för att hjälpa pojken, som ska ha blivit både slagen och hånad av andra elever.
Tvisten kommer att avgöras i Gotlands tingsrätt om en månad. Det är första ärendet i Sverige som Skolinspektionens Barn- och elevombud driver till domstol efter att den nya skarpare lagstiftning började gälla 1 april 2006.
Lagen innebär bland annat att det kommer att bli lättare att kräva kommuner på skadestånd.
Beo anklagar Gotlands kommun för att inte ha levt upp till kravet i skollagen som förbjuder diskriminering och annan kränkande behandling av barn.
Enligt deras uppgifter har pojken som då gick i årskurs 4 blivit kränkt både fysiskt och verbalt.
I anmälan skriver Beo att elever lagt krokben på pojken och skrattat åt honom, slagit honom i huvudet med böcker och pingisracket, kastat hårda föremål på honom och nypt honom i ansiktet.
De har också hävt ur sig nedsättande kommentarer som gjort honom ledsen och sårad.
Kränkt av kontrakt
Beo anser att skolan inte gjort tillräckligt för att få stopp på mobbningen och anklagar ansvariga för att ha ställt stora krav på att eleven själv skulle agera när han utsatts för kränkningar.
Åtgärder som att pojken fått sitta inne på rasterna och ha en mobiltelefon, gör inte att kränkningarna upphör, anser Beo.
Pojken fick även skriva på ett slags kontrakt vilket ledde till att han bara kände sig ännu mera kränkt, den här gången av skolans personal.
Motsättning
Pojken har ofta haft ont i huvudet och magen och inte velat gå i skolan på grund av trakasserierna. Till slut bytte han till en annan skola.
Gotlands kommun krävs efter händelserna på 40 000 kronor i skadestånd.
Kommunen delar inte Beo:s uppfattning om vad som hänt, och motsätter sig att betala. Skolan säger att pojken har haft svårt att anpassa sig socialt och att man skärpt bevakningen på skolgården och alltid haft två vuxna ute på rasterna.
Nidsång på nätet
Beo har nu drivit ytterligare två ärenden till domstol. Det högsta kravet på skadestånd gäller en elev i Göteborg stad, som stäms på 240 000 kronor.
Den eleven kränktes med en nidsång som lagts ut på internet, samt utsattes för hot, fysiska angrepp och sönderskurna skor.