Per-Erling Evensen säger till SR Gotland att problemet uppstod i veckan när betalningssystemet skulle uppdateras.
Han vädjar därför till resenärerna att ha med sig kontanter ombord.
- Det är ett problem som man inte kommer åt just nu. Men så här skall det naturligtvis inte vara, säger Per-Erling Evensen.
Förhoppningen är att felet ska vara åtgärdat så fort som möjligt.
Passagerarna har ingen möjlighet att få handla på kredit tills felet är åtgärdat.
- Vi har försökt gå ut med att vi inte kan ta emot kort.
Felet gäller bara korthanteringen ombord på färjorna. I terminalen och när man kör ombord fungerar allt som vanligt.