Problemen för flygbolaget började redan på måndagen med två inställda flighter på grund av en konflikt med pilotfacket som varslat om övertidsblockad.
Av samma anledning ställdes tisdagens flighter in, avgångarna 14.30 och 20.45 från Bromma och 12.25 och 16.30 från Visby.
Bras regionchef Sakarias Ronqvist kan inte svara på om flygbolaget kommer att tvingas ställa in fler flighter den här veckan.
– Men som det ser ut just nu har vi inga inställda under onsdagen, säger han.
Resenärerna informeras via sms och bokas om till andra flighter.